Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mid2Q9QUS6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mid2Q9QUS6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mid2Q9QUS6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mid2Q9QUS6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mid2Q9QUS6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mid2Q9QUS6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mid2Q9QUS6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mid2Q9QUS6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mid2Q9QUS6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mid2Q9QUS6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mid2Q9QUS6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mid2Q9QUS6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid2Q9QUS6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid2Q9QUS6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid2Q9QUS6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid2Q9QUS6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid2Q9QUS6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid2Q9QUS6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid2Q9QUS6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid2Q9QUS6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid2Q9QUS6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid2Q9QUS6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid2Q9QUS6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid2Q9QUS6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid2Q9QUS6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid2Q9QUS6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid2Q9QUS6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid2Q9QUS6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid2Q9QUS6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid2Q9QUS6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms