Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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