Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
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Rabgef1Q9JM13 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Rabgef1Q9JM13 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Rabgef1Q9JM13 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Rabgef1Q9JM13 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Rabgef1Q9JM13 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Rabgef1Q9JM13 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Rabgef1Q9JM13 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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