Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

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Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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Tmod4Q9JLH8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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Tmod4Q9JLH8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Tmod4Q9JLH8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Tmod4Q9JLH8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Tmod4Q9JLH8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Tmod4Q9JLH8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Tmod4Q9JLH8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Tmod4Q9JLH8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Tmod4Q9JLH8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Tmod4Q9JLH8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Tmod4Q9JLH8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms