Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms