Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tlr5Q9JLF7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tlr5Q9JLF7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tlr5Q9JLF7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tlr5Q9JLF7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tlr5Q9JLF7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tlr5Q9JLF7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tlr5Q9JLF7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tlr5Q9JLF7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tlr5Q9JLF7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tlr5Q9JLF7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tlr5Q9JLF7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tlr5Q9JLF7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tlr5Q9JLF7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tlr5Q9JLF7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tlr5Q9JLF7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tlr5Q9JLF7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tlr5Q9JLF7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tlr5Q9JLF7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tlr5Q9JLF7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tlr5Q9JLF7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tlr5Q9JLF7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tlr5Q9JLF7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tlr5Q9JLF7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tlr5Q9JLF7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tlr5Q9JLF7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tlr5Q9JLF7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tlr5Q9JLF7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tlr5Q9JLF7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tlr5Q9JLF7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tlr5Q9JLF7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tlr5Q9JLF7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tlr5Q9JLF7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tlr5Q9JLF7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tlr5Q9JLF7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tlr5Q9JLF7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tlr5Q9JLF7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tlr5Q9JLF7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tlr5Q9JLF7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tlr5Q9JLF7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tlr5Q9JLF7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tlr5Q9JLF7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tlr5Q9JLF7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tlr5Q9JLF7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tlr5Q9JLF7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tlr5Q9JLF7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tlr5Q9JLF7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tlr5Q9JLF7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tlr5Q9JLF7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tlr5Q9JLF7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tlr5Q9JLF7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tlr5Q9JLF7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tlr5Q9JLF7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tlr5Q9JLF7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tlr5Q9JLF7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tlr5Q9JLF7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tlr5Q9JLF7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tlr5Q9JLF7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tlr5Q9JLF7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tlr5Q9JLF7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tlr5Q9JLF7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tlr5Q9JLF7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tlr5Q9JLF7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tlr5Q9JLF7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tlr5Q9JLF7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tlr5Q9JLF7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tlr5Q9JLF7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tlr5Q9JLF7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tlr5Q9JLF7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tlr5Q9JLF7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tlr5Q9JLF7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tlr5Q9JLF7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tlr5Q9JLF7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tlr5Q9JLF7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tlr5Q9JLF7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tlr5Q9JLF7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tlr5Q9JLF7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlr5Q9JLF7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlr5Q9JLF7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlr5Q9JLF7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlr5Q9JLF7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlr5Q9JLF7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlr5Q9JLF7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlr5Q9JLF7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlr5Q9JLF7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlr5Q9JLF7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlr5Q9JLF7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlr5Q9JLF7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlr5Q9JLF7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlr5Q9JLF7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlr5Q9JLF7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlr5Q9JLF7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlr5Q9JLF7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlr5Q9JLF7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlr5Q9JLF7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlr5Q9JLF7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlr5Q9JLF7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlr5Q9JLF7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlr5Q9JLF7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlr5Q9JLF7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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