Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms