Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms