Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms