Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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