Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms