Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms