Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ4

Ube2j1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2j1Q9JJZ4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Ube2j1Q9JJZ4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2j1Q9JJZ4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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