Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Alyref2Q9JJW6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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