Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms