Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms