Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc12a4Q9JIS8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc12a4Q9JIS8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc12a4Q9JIS8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc12a4Q9JIS8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc12a4Q9JIS8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc12a4Q9JIS8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc12a4Q9JIS8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc12a4Q9JIS8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc12a4Q9JIS8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc12a4Q9JIS8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc12a4Q9JIS8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc12a4Q9JIS8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc12a4Q9JIS8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc12a4Q9JIS8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc12a4Q9JIS8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms