Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIC3

Dclre1a, DNA cross-link repair 1A protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1aQ9JIC3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Dclre1aQ9JIC3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms