Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIA1

Lgi1, Leucine-rich glioma-inactivated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgi1Q9JIA1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgi1Q9JIA1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgi1Q9JIA1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgi1Q9JIA1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgi1Q9JIA1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgi1Q9JIA1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgi1Q9JIA1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgi1Q9JIA1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgi1Q9JIA1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgi1Q9JIA1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgi1Q9JIA1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgi1Q9JIA1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgi1Q9JIA1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lgi1Q9JIA1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Lgi1Q9JIA1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lgi1Q9JIA1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lgi1Q9JIA1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lgi1Q9JIA1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lgi1Q9JIA1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms