Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms