Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms