Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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