Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms