Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERG0

Lima1, LIM domain and actin-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lima1Q9ERG0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms