Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE7

Mesd, LRP chaperone MESD, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MesdQ9ERE7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
MesdQ9ERE7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MesdQ9ERE7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MesdQ9ERE7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MesdQ9ERE7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MesdQ9ERE7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MesdQ9ERE7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MesdQ9ERE7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MesdQ9ERE7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MesdQ9ERE7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MesdQ9ERE7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MesdQ9ERE7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MesdQ9ERE7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MesdQ9ERE7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MesdQ9ERE7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MesdQ9ERE7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MesdQ9ERE7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MesdQ9ERE7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MesdQ9ERE7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MesdQ9ERE7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MesdQ9ERE7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms