Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms