Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms