Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Cxcr6Q9EQ16 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Cxcr6Q9EQ16 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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