Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ropn1lQ9EQ00 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms