Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SyncQ9EPM5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms