Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL5

Mmp1a, Interstitial collagenase A, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp1aQ9EPL5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp1aQ9EPL5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms