Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms