Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tspan4Q9DCK3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tspan4Q9DCK3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tspan4Q9DCK3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tspan4Q9DCK3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tspan4Q9DCK3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tspan4Q9DCK3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Tspan4Q9DCK3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan4Q9DCK3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan4Q9DCK3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan4Q9DCK3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan4Q9DCK3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan4Q9DCK3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan4Q9DCK3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan4Q9DCK3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Tspan4Q9DCK3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan4Q9DCK3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan4Q9DCK3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan4Q9DCK3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan4Q9DCK3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan4Q9DCK3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan4Q9DCK3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan4Q9DCK3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Tspan4Q9DCK3 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan4Q9DCK3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan4Q9DCK3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan4Q9DCK3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan4Q9DCK3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan4Q9DCK3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan4Q9DCK3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan4Q9DCK3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan4Q9DCK3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan4Q9DCK3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan4Q9DCK3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan4Q9DCK3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan4Q9DCK3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan4Q9DCK3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan4Q9DCK3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan4Q9DCK3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan4Q9DCK3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Tspan4Q9DCK3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Tspan4Q9DCK3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Tspan4Q9DCK3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan4Q9DCK3 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Tspan4Q9DCK3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan4Q9DCK3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan4Q9DCK3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan4Q9DCK3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan4Q9DCK3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan4Q9DCK3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Tspan4Q9DCK3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Tspan4Q9DCK3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Tspan4Q9DCK3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Tspan4Q9DCK3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tspan4Q9DCK3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tspan4Q9DCK3 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tspan4Q9DCK3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tspan4Q9DCK3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tspan4Q9DCK3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Tspan4Q9DCK3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tspan4Q9DCK3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tspan4Q9DCK3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tspan4Q9DCK3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tspan4Q9DCK3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tspan4Q9DCK3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tspan4Q9DCK3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tspan4Q9DCK3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Tspan4Q9DCK3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tspan4Q9DCK3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tspan4Q9DCK3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tspan4Q9DCK3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tspan4Q9DCK3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tspan4Q9DCK3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tspan4Q9DCK3 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tspan4Q9DCK3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tspan4Q9DCK3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tspan4Q9DCK3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tspan4Q9DCK3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tspan4Q9DCK3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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