Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms