Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY1

Syvn1, E3 ubiquitin-protein ligase synoviolin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syvn1Q9DBY1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syvn1Q9DBY1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syvn1Q9DBY1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syvn1Q9DBY1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syvn1Q9DBY1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syvn1Q9DBY1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syvn1Q9DBY1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syvn1Q9DBY1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syvn1Q9DBY1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syvn1Q9DBY1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syvn1Q9DBY1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syvn1Q9DBY1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syvn1Q9DBY1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syvn1Q9DBY1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syvn1Q9DBY1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syvn1Q9DBY1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syvn1Q9DBY1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syvn1Q9DBY1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syvn1Q9DBY1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syvn1Q9DBY1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syvn1Q9DBY1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syvn1Q9DBY1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syvn1Q9DBY1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syvn1Q9DBY1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syvn1Q9DBY1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syvn1Q9DBY1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syvn1Q9DBY1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syvn1Q9DBY1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syvn1Q9DBY1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syvn1Q9DBY1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syvn1Q9DBY1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syvn1Q9DBY1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syvn1Q9DBY1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syvn1Q9DBY1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syvn1Q9DBY1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syvn1Q9DBY1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syvn1Q9DBY1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syvn1Q9DBY1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syvn1Q9DBY1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syvn1Q9DBY1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms