Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms