Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC0

Selenoo, Selenoprotein O, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenooQ9DBC0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms