Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms