Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms