Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift43Q9DA69 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift43Q9DA69 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift43Q9DA69 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift43Q9DA69 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift43Q9DA69 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift43Q9DA69 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift43Q9DA69 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift43Q9DA69 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift43Q9DA69 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift43Q9DA69 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift43Q9DA69 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift43Q9DA69 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ift43Q9DA69 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ift43Q9DA69 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift43Q9DA69 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ift43Q9DA69 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift43Q9DA69 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift43Q9DA69 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ift43Q9DA69 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Ift43Q9DA69 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Ift43Q9DA69 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Ift43Q9DA69 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Ift43Q9DA69 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift43Q9DA69 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Ift43Q9DA69 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift43Q9DA69 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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