Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms