Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Pdzd9Q9D9M4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdzd9Q9D9M4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdzd9Q9D9M4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdzd9Q9D9M4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdzd9Q9D9M4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdzd9Q9D9M4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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