Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp12Q9D9M2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp12Q9D9M2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp12Q9D9M2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp12Q9D9M2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp12Q9D9M2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp12Q9D9M2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp12Q9D9M2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp12Q9D9M2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp12Q9D9M2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp12Q9D9M2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp12Q9D9M2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp12Q9D9M2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp12Q9D9M2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp12Q9D9M2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp12Q9D9M2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp12Q9D9M2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp12Q9D9M2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp12Q9D9M2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp12Q9D9M2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp12Q9D9M2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp12Q9D9M2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms