Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms