Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms