Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms