Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rep15Q9D7T1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rep15Q9D7T1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rep15Q9D7T1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rep15Q9D7T1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rep15Q9D7T1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rep15Q9D7T1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rep15Q9D7T1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Rep15Q9D7T1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Rep15Q9D7T1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Rep15Q9D7T1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Rep15Q9D7T1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Rep15Q9D7T1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Rep15Q9D7T1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
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Rep15Q9D7T1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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