Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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