Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6X5

Slc52a3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a3Q9D6X5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms