Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
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Sec23bQ9D662 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Sec23bQ9D662 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Sec23bQ9D662 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Sec23bQ9D662 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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